در پی حمایت عجیب سیدحسن خمینی از ورود بیضابطه میلیونها مهاجر افغان به ایران، روزنامه جمهوری اسلامی نوشت: کسي که براي اتباع افغانستانی در حرم امام جلسه میگذارد به اين سؤال اساسي جواب بدهد که چگونه به خود اجازه ميدهيد نفوذيهای طالبان را با فاطميون که همه ما قدردان آنها هستيم مقايسه کنید؟ شما يا از افکار عمومی مردم ايران که يکپارچه خواستار اخراج اتباع غيرمجاز افغانستانی هستند بيخبر هستيد که در اينصورت حق اظهارنظر در اين زمينه را نداريد و يا اطلاع داريد و اينگونه برخلاف اراده مردم ايران از تهديدکنندگان امنيت کشور حمايت ميکنيد. چنين فردي چگونه به خود حق ميدهد سخن حق هشداردهندگان درباره تهديدهاي اتباع غيرمجاز افغانستانی را دروغ بداند و در عين حال از انتساب خود به امام خمينی سخن بگويد؟ خواص، از انگيزه شما براي حمايت از جماعت موردنظرتان جهت گرم کردن بازارتان اطلاع دارند، کاری نکنيد که جزئيات آن را به اطلاع عموم برسانند. پرونده تشريفاتی ساختن حرم امام سادهزيست، جهت درس گرفتن از روزگار براي شما کافي نيست؟!